Curso Metagenômica e Descoberta de Vírus

DOWNLOADS
Aqui você pode encontrar todas as aulas teóricas e tutoriais das aulas práticas do curso. A transferência dos arquivos para o uso individual é livre. É proibido o uso e/ou alteração total ou parcial do conteúdo desses arquivos para exibição pública e/ou comercial sem permissão dos autores.
Aulas Teóricas
Metagenomics - challenges for viral detection and discovery
Rational design of profile HMMs of viral markers
Viral genome reconstruction and provirus finding with profile HMMs
Learning on viruses
Aulas Práticas
Usando SSH e X2Go
Tutorial 1: sequence retrieval, alignment, model design and application on metagenomic datasets
TABAJARA - Manual
HMM-Prospector - Manual
e-Finder - Manual
Tutorial 2: Seed-driven assembly using GenSeed-HMM and profile HMMs
Tutorial 3: Finding proviruses in bacterial genomes with e-Finder program
Practical Introduction to Machine Learning and SVMs
Random Forest Classifier and viral application
Dimension Reduction and Clustering
ViennaRNA on single models
Infernal and covariance models
Code examples and files used in the workshop
Fotos do curso
Fotos do curso - não editadas (arquivo comprimido - xxx MB)