BMP0216
Genômica e Bioinformática
2015

Programa da Disciplina


 

 

Dia
Horário
Local
Aula
Assunto
Docente
13/08

Qui

8:00-9:00

Sala 3 ICB4

Teórica
Introdução à disciplina:
objetivos, conteúdo, aulas práticas, avaliação, home page

Todos

9:30-12:00
Salas 4 e 5 ICB4
Teórica
J. Marcelo
20/08

Qui

8:00-9:00
Sala 3 ICB4
Teórica
J. Marcelo
9:30-12:00
Salas 4 e 5 ICB4
Prática

Tutorial 1: sistema Linux, login remoto, interface gráfica, linha de comando / Instalando o MobaXterm / teste.fasta

Arthur / Robson
27/08

Qui

8:00-9:00
Sala 3 ICB4
Teórica
Robson
9:30-12:00 Salas 4 e 5 ICB4 Prática
Tutorial 2: buscas de similaridade e BLAST -  construção de bancos locais, realização de buscas em linha de comando e interface gráfica, interpretação dos resultados
Robson / J. Marcelo
03/09

Qui

8:00-9:00 Sala 3 ICB4
Teórica
Motivos proteicos: abordagens e aplicações Robson
9:30-12:00
Salas 4 e 5 ICB4
Prática
Tutorial 3: análise de motivos proteicos na web e em linha de comando
Robson / J. Marcelo

10/09

Qui

Semana da Pátria  
NÃO HAVERÁ AULA
17/09

Qui

8:00-9:00
Sala 3 ICB4
Teórica
Arthur
9:30-12:00 Salas 4 e 5 ICB4 Prática Tutorial 4: montagem de DNA Arthur / J. Marcelo
24/09

Qui

8:00-9:00
Sala 3 ICB4
Teórica
Arthur
9:30-12:00
Salas 4 e 5 ICB4
Prática
Tutorial 5: anotação com o programa Artemis
Arthur / J. Marcelo
01/10

Qui

8:00-9:00
Sala 3 ICB4
Teórica
Conceitos básicos de evolução molecular e ortologia
Robson
9:30-12:00 Salas 4 e 5 ICB4 Prática Tutorial 6: análise filogenética Robson / J. Marcelo

08/10

Qui

8:00-9:00 Sala 3 ICB4 Teórica Bases de dados de ortologia e vias metabólicas J. Marcelo
9:30-12:00 Salas 4 e 5 ICB4 Prática Tutorial 7: uso das bases eggNOG e KEGG

J. Marcelo / Robson

15/10

Qui

8:00-10:30 Sala 3 ICB4 Prova Prova Escrita 1 Todos
11:00-12:00 Anfiteatro Rosa Teórica Aplicações da Bioinformática para a diagnóstico molecular - um exemplo: "GenSeed-HMM: uma nova abordagem para a descoberta de novos vírus e sua aplicação em dados metagenômicos" Arthur

22/10

Qui

8:00-9:00 Sala 3 ICB4 Teórica RNA-seq (Convidado: Dr. Pedro Galante - Hospital Sírio Libanês) /Aula extra sobre RNAseq Arthur / Robson
9:30-12:00 Salas 4 e 5 ICB4 Prática Tutorial 8: ferramentas para análise de RNA-seq (Convidado: Pedro Galante - Hospital Sírio Libanês) Arthur / Robson

29/10

Qui

8:00-9:00 Sala 3 ICB4 Teórica Medicina Genômica - um exemplo: "Aplicação da Bioinformática no estudo de doenças psiquiátricas": parte 1 / parte 2 (Convidada: Profa. Dra. Helena P. Brentani - Instituto de Psiquiatria - FMUSP) Todos
9:30-12:00 Salas 4 e 5 ICB4 Prática Tutorial:  a definir (Convidada: Profa. Dra. Helena P. Brentani - Instituto de Psiquiatria - FMUSP) Todos

05/11

Qui

X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics  
NÃO HAVERÁ AULA

12/11

Qui

8:00-9:00 Sala 3 ICB4 Teórica

Biologia de sistemas (Convidado: Prof. Dr. Helder Nakaya - FCF/USP)

J. Marcelo / Robson
9:30-12:00 Salas 4 e 5 ICB4 Prática Tutorial 9: Cytoscape e outras ferramentas (Convidado: Prof. Dr. Helder Nakaya - FCF/USP) J. Marcelo / Robson

19/11

Qui

8:00-9:00 Sala 3 ICB4 Teórica Anotação integrada de genomas e transcritos: sistemas de pipelines Arthur
9:30-12:00 Salas 4 e 5 ICB4 Prática Tutorial 10: pipelines de anotação automática Arthur / Robson

26/11

8:00-9:45 Sala 3 ICB4 Seminários Apresentação dos Seminários 1 a 4 Todos
10:15-12:00 Sala 3 ICB4 Seminários Apresentação dos Seminários 5 a 8 / Todos os seminários Todos

03/12

Qui

8:00-9:00 Sala 3 ICB4 Discussão Entrega de trabalhos escritos e discussão Todos
9:30-12:00 Sala 3 ICB4 Prova Prova Escrita 2 Todos