BMP0216 |
Genômica e Bioinformática |
2015 |
Programa da Disciplina |
Dia |
Horário |
Local |
Aula |
Assunto |
Docente |
13/08
Qui |
8:00-9:00 |
Sala 3 ICB4 |
Teórica |
Introdução à disciplina: objetivos, conteúdo, aulas práticas, avaliação, home page |
Todos |
9:30-12:00 |
Salas 4 e 5 ICB4 |
Teórica |
J. Marcelo | ||
20/08
Qui |
8:00-9:00 |
Sala 3 ICB4 |
Teórica |
J. Marcelo | |
9:30-12:00 |
Salas 4 e 5 ICB4 |
Prática |
Tutorial 1: sistema Linux, login remoto, interface gráfica, linha de comando / Instalando o MobaXterm / teste.fasta |
Arthur / Robson | |
27/08
Qui |
8:00-9:00 |
Sala 3 ICB4 |
Teórica |
|
Robson |
9:30-12:00 | Salas 4 e 5 ICB4 | Prática |
Tutorial 2: buscas de similaridade e BLAST - construção de bancos locais, realização de buscas em linha de comando e interface gráfica, interpretação dos resultados |
Robson / J. Marcelo | |
03/09
Qui |
8:00-9:00 | Sala 3 ICB4 | Teórica |
Motivos proteicos: abordagens e aplicações | Robson |
9:30-12:00 |
Salas 4 e 5 ICB4 |
Prática |
Robson / J. Marcelo | ||
10/09 Qui |
Semana da Pátria NÃO HAVERÁ AULA |
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17/09
Qui |
8:00-9:00 |
Sala 3 ICB4 |
Teórica |
Arthur | |
9:30-12:00 | Salas 4 e 5 ICB4 | Prática | Tutorial 4: montagem de DNA | Arthur / J. Marcelo | |
24/09
Qui |
8:00-9:00 |
Sala 3 ICB4 |
Teórica |
Arthur | |
9:30-12:00 |
Salas 4 e 5 ICB4 |
Prática |
Arthur / J. Marcelo | ||
01/10
Qui |
8:00-9:00 |
Sala 3 ICB4 |
Teórica |
Conceitos básicos de evolução molecular e ortologia |
Robson |
9:30-12:00 | Salas 4 e 5 ICB4 | Prática | Tutorial 6: análise filogenética | Robson / J. Marcelo | |
08/10 Qui |
8:00-9:00 | Sala 3 ICB4 | Teórica | Bases de dados de ortologia e vias metabólicas | J. Marcelo |
9:30-12:00 | Salas 4 e 5 ICB4 | Prática | Tutorial 7: uso das bases eggNOG e KEGG | J. Marcelo / Robson |
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15/10 Qui |
8:00-10:30 | Sala 3 ICB4 | Prova | Prova Escrita 1 | Todos |
11:00-12:00 | Anfiteatro Rosa | Teórica | Aplicações da Bioinformática para a diagnóstico molecular - um exemplo: "GenSeed-HMM: uma nova abordagem para a descoberta de novos vírus e sua aplicação em dados metagenômicos" | Arthur | |
22/10 Qui |
8:00-9:00 | Sala 3 ICB4 | Teórica | RNA-seq (Convidado: Dr. Pedro Galante - Hospital Sírio Libanês) /Aula extra sobre RNAseq | Arthur / Robson |
9:30-12:00 | Salas 4 e 5 ICB4 | Prática | Tutorial 8: ferramentas para análise de RNA-seq (Convidado: Pedro Galante - Hospital Sírio Libanês) | Arthur / Robson | |
29/10 Qui |
8:00-9:00 | Sala 3 ICB4 | Teórica | Medicina Genômica - um exemplo: "Aplicação da Bioinformática no estudo de doenças psiquiátricas": parte 1 / parte 2 (Convidada: Profa. Dra. Helena P. Brentani - Instituto de Psiquiatria - FMUSP) | Todos |
9:30-12:00 | Salas 4 e 5 ICB4 | Prática | Tutorial: a definir (Convidada: Profa. Dra. Helena P. Brentani - Instituto de Psiquiatria - FMUSP) | Todos | |
05/11 Qui |
X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics NÃO HAVERÁ AULA |
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12/11 Qui |
8:00-9:00 | Sala 3 ICB4 | Teórica | Biologia de sistemas (Convidado: Prof. Dr. Helder Nakaya - FCF/USP) |
J. Marcelo / Robson |
9:30-12:00 | Salas 4 e 5 ICB4 | Prática | Tutorial 9: Cytoscape e outras ferramentas (Convidado: Prof. Dr. Helder Nakaya - FCF/USP) | J. Marcelo / Robson | |
19/11 Qui |
8:00-9:00 | Sala 3 ICB4 | Teórica | Anotação integrada de genomas e transcritos: sistemas de pipelines | Arthur |
9:30-12:00 | Salas 4 e 5 ICB4 | Prática | Tutorial 10: pipelines de anotação automática | Arthur / Robson | |
26/11 |
8:00-9:45 | Sala 3 ICB4 | Seminários | Apresentação dos Seminários 1 a 4 | Todos |
10:15-12:00 | Sala 3 ICB4 | Seminários | Apresentação dos Seminários 5 a 8 / Todos os seminários | Todos | |
03/12 Qui |
8:00-9:00 | Sala 3 ICB4 | Discussão | Entrega de trabalhos escritos e discussão | Todos |
9:30-12:00 | Sala 3 ICB4 | Prova | Prova Escrita 2 | Todos |
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